处侦查，主将冲入战场时也会一起伴随左右，撤退时更要为主将殿后。
除了在危险时保护主公、战局危急时奔赴战场外，一些旗本武士还会协助大名制定计划，监管部队的运作，担任军奉行、军目付的职位，一些旗本武士还会在战场之外作为大名重要的家臣团，继续辅佐主君治理领国。
而大名为了巩固和旗本武士的关系，除了采用联姻、收养养子、赐予本家通字等方式来表示亲近，还可以用索要誓书的办法确立忠诚，因此旗本武士的战斗力和忠诚度都十分可怕，哪怕战至最后一人也会不死不休。
细川澄元万万没想到细川高国早已做好迎战自己的准备，甚至好在府外布置了一支奇兵。
内外夹击之下，自己的人马被打得溃不成军，只好迅速发出信号等待援军前来，自己则与三好之长收拢人马苦苦抵御细川高国一方的进攻。
二人血战了半个时辰，巷子内早已血流成河，残肢遍地，但丝毫没有援军到来的痕迹，心中不由生出几分不祥的预感。
细川澄元的预感没错，在其手下见到信号后刚准备赶去支援，就发现前路早已被一群来历不明的人挡住，借着朦胧的月光，众人发现对方背后的战旗上竟印着六角氏的家徽，还没等他们开口询问，对方已经提刀杀将过来，双方在月夜下又陷入一场混战。
月黑风高夜，杀人放火天。
京畿内的两处混战早已经引起各方势力的注意，但却没人主动卷入这场细川家的内斗，更让各方没想到的是，近江国的六角氏不知何时偷偷潜入京畿，成为细川高国的盟友。
近江国的六角高赖早就想进入京畿提升六角氏的影响力，但一直苦于没有理由插手其中，因此面对细川高国派来求助的信使，当即表示愿意支持高国，并派出自己的嫡子六角定赖亲率武士前往京畿驰援，并让信使转告细川高国：若不是自己在攻陷冈山城时身受重伤，定会亲自前往。
细川高国正是因为得到六角氏的鼎力支持，才敢如此有恃无恐，在寿宴上对足利义稙进行羞辱，面对足利义澄的围攻，也选择主动出击，将其困杀在京畿内。
一道锋利的银光闪过，三好之长忙举剑格挡，只听一声清鸣的金属交击声过后，三好之长手中的武士刀被从中斩断，银光带着死亡之吻划过三好之长的前胸。
断刀坠地，胸腔爆裂，伴随着“叮鸣”声，三好之长的胸腔被细川高国手中的名剑童子切划开，鲜红色血液伴随着腹部挤出的肠子一同往外喷洒。
细川澄元眼睁睁地看着自己最忠实的手下被细川高国斩杀，不由怒火中烧，爆喝一声举剑猛击，将一直缠着自己的香西元盛逼得节节败退。
香西元盛武艺高超，趁细川澄元盛怒，暂避其锋，引其进入险境，而后一招突刺命中澄元大腿，将其击伤。
细川澄元见三好之长战死，自己又身负重伤，援军不知为何迟迟未到，若是还留在此处性命必将不保，因此大喝一声撤退，在手下旗本武士的护卫下匆匆撤离战巷。
京畿，义晴居所。
在细川高国与细川澄元开战的同时，足利义晴这边也遭遇险境。
足利义晴和赤松义村正在谈论京畿局势，忽然听闻外面传来一阵凄厉的惨叫声，正欲出门查探，一阵猛烈地箭雨从窗外射进，二人忙趴在地上这才躲过一劫。
二人将案上蜡烛熄灭，在黑暗中悄悄爬出房间，想趁夜色昏暝逃出此处，谁知刚爬进院中，就发现四周却已经布满身穿黑衣面蒙黑巾的武士。
黑衣武士离二人越来越近，义晴紧紧握住手中的名剑三日月，准备与对方殊死一搏，就在两名黑衣武士距义晴仅有数尺时，一道清冷的剑光忽然划破黑夜，照印出这两名武士濒临死亡时惊恐绝望的眼神，使他们连惨叫都
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